CN990 - это диагностический порт. Rx и Tx там нет. Распиновку порта диагностики указывал Альтмер:
http://www.arts-union.ru/smf/index.php? ... 35#msg3335 , там же есть примеры работы с ним.
- Последовательных интерфейсов, совместимых с последовательным портом PC, в 3DO не использовалось.
- Если вас интересуют история и особенности PC-совместимого последовательного интерфейса в игровых приставках - обратите лучше внимание на Philips CD-I, там использовался RS-232C для подключения периферии и PC. 3DO - не в тему.
- Перепрошивать в 3DO нечего.